Het aangeboren afweersysteem staat altijd direct klaar en werkt snel. Het is echter niet specifiek tegen een bepaalde ziekteverwekker gericht. Dit onderdeel heeft ook geen geheugen, in tegenstelling tot het aangeleerde afweersysteem. Voor het aangeboren afweersysteem bestaat er geen verschil in de afweerreactie wanneer je voor de tweede of derde keer met dezelfde ziekteverwekker in aanraking komt, terwijl de aangeleerde afweer bij elke volgende besmetting met dezelfde ziekteverwekker, een betere en snellere bescherming geeft. Dit komt omdat dit deel van het afweersysteem zich herinnert dat een bepaalde ziekteverwekker al eerder het lichaam is binnengedrongen, waardoor het snel en specifiek kan reageren op deze hernieuwde infectie.